【人物】大卫·贝克 | 从哲学研究到诺贝尔化学奖 | Rosetta | 蛋白质结构预测 | Foldit | RoseTTAFold | RFdiffusion #

2024年的诺贝尔化学奖颁给了华盛顿大学的大卫·贝克教授，这位科学家并非像DeepMind的CEO哈萨比斯那样广为人知，但他对蛋白质设计领域的贡献却意义非凡。贝克教授的科研之路颇具传奇色彩，他最初在哈佛大学主修哲学和社会研究，一次偶然的发育生物学实验激发了他对蛋白质结构的浓厚兴趣，从此踏上了生物化学的研究生涯。

贝克先后在兰迪·谢克曼和戴维·阿加德教授的实验室深造，并于1993年回到家乡华盛顿大学，开始了蛋白质结构预测软件Rosetta的研发。为了解决计算资源不足的问题，贝克团队发起了Rosetta@home项目，邀请全球志愿者贡献闲置算力，并创建了Rosetta Commons学术社区，汇聚了来自世界各地的学者，共同推动蛋白质结构研究的发展。

受Rosetta@home项目的启发，贝克团队于2008年推出了在线益智游戏Foldit，让大众参与蛋白质折叠，并成功破解了困扰科学家长达15年的M-PMV逆转录病毒蛋白酶的晶体结构。然而，2020年底，AlphaFold 2的出现给Rosetta带来了巨大挑战。面对竞争，贝克没有退缩，而是秉持开源共享的精神，带领团队研发出深度学习模型RoseTTAFold，最终与AlphaFold 2实现了共享与共同进步。

在与AlphaFold 2的竞争后，贝克将深度学习技术拓展到蛋白质设计领域，并成功设计出世界上第一个全新蛋白质Top7。近年来，贝克团队又相继开发了RFdiffusion和ProteinMPNN等先进工具，极大地推动了蛋白质设计的发展。贝克还积极推动科研成果的产业化落地，成立了多家公司，将AI技术应用于药物研发、疾病治疗等领域。他的研究成果不仅在学术界取得了巨大突破，也为人类健康和社会发展带来了新的希望。